アレッツォで最も重要な教会の一つであるサン・フランチェスコ教会は、特に世界美術史上最も魅力的な絵画の一つである、ピエロ・デッラ・フランチェスカ（1418年頃-1492年没）制作のフレスコ画「聖十字架伝説」が保存された教会としてその名が知られています。
フランチェスコ修道士たちがポッジョ・デル・ソーレの丘にあった修道院から町に移ることを許可されたのを発端に、13世紀末期から教会の建設が始まり、ジョヴァンニ・ダ・ピストイアによって計画が進められました。唯一の身廊からなる教会内部は14-15-16世紀にかけて装飾され、後陣の中央礼拝堂は1447-66年にかけてフレスコ画が描かれました。
側壁の壁龕や礼拝堂、フレスコ画は町の裕福層によって制作依頼された価値の高い作品ばかりでしたが、他の全ての教会に見られるように、残念ながらその後何世紀にも渡って損傷や略奪、破壊を受けました。
19世紀以降、バッチ礼拝堂の修復作業が何度か繰り返されますが、20世紀以降のピエロ・デッラ・フランチェスカへの再評価のおかげで、最高のスタッフと最新の技術が導入され、15年間に渡る修復作業が完了したのはつい最近のことです。1955年から教会は、最高位の聖堂（バジリカ）の称号を与えられました。
未完成のファサードは、上塗りされていない13世紀の石壁がむき出しのままになっています。教会裏手のベッケリア通りから、砂岩造りの後陣と1870年に取り壊されたフランチェスコ修道院の残骸を見ることができます。最近の発掘調査では、教会の地下墓地で考古学上非常に興味深い、紀元前6世紀から19世紀にかけて何層にも積み重なった地層が発見されています。
教会内部（53メートル×17メートル）は唯一の広い身廊から成り、側壁が壁龕や礼拝堂で装飾され、中央の床面には墓石が埋め込まれています。天井は木製の化粧屋根裏天井で覆われています。
アレッツォの名門バッチ家が、1408年にサン・フランチェスコ教会の中央礼拝堂を一族の礼拝堂として利用できる許可を手に入れ、1447年にフィレンツェ出身の年老いた画家ビッチ・ディ・ロレンツォ（1368年頃-1452年）に礼拝堂の装飾を依頼しました。彼はジェノバの大司教ヤコブス・デ・ウォラギネが集大成した聖人伝「黄金伝説」（1205年）に収められた「聖十字架伝説」をモチーフにしたフレスコ画制作の作業に取りかかりますが、1452年に亡くなります。亡くなる前に彼は、礼拝堂の前壁面上部のフレスコ画「最後の審判」とヴォールトの4つの帆型壁のフレスコ画「福音史家」を描き上げました。
ピエロ・デッラ・フランチェスカは、ビッチ・ディ・ロレンツォが亡くなる1452年より前に、既にフレスコ画制作に着手していたと思われ、10年以上の歳月をかけてフレスコ画を完成させました。その間、ローマでの制作活動（1452-56年）のために作業は一時中断しますが、このローマでの活動がその後のフレスコ画制作に影響を与えました。彼は物語を構成する10の場面の年代順配列にはこだわらず、各場面の関連性を考慮しながら調和の取れた配列を実現しました。
